Saison 1 (1999) - 40 épisodes (01 à 40)
| N° | |
| 1 | A | Bienvenue à bord |
| B | Le grand nettoyage |
| C | Asphyxie en chaîne |
| 2 | A | Sculptures sur bulles |
| B | Un nouveau comique |
| 3 | A | La pêche à la méduse |
| B | La faim du plankton |
| 4 | A | La zizanie |
| B | Le permis de conduire |
| 5 | A | Les livreurs de pizza |
| B | On a mangé ma maison |
| 6 | A | Les vieux super héros |
| B | Le cornichon manquant |
| 7 | A | La jeune recrue |
| B | Les envahisseurs |
| 8 | A | La fusée |
| B | Un bruit insupportable |
| 9 | A | L'appel de la nature |
| B | Le jour des contraires |
| 10 | A | Le gala |
| B | Le blues du plankton |
| 11 | A | Les bras gonflables |
| B | Le fantôme de Carlo |
| 12 | A | Le chaperon |
| B | L'employé du mois |
| 13 | A | Une peur incontrôlable |
| B | Un escargot affamé |
| 14 | A | Voyage dans le temps |
| B | Fous de karaté |
| 15 | A | Rêver sans y être invité |
| B | Docteur Patrick |
| 16 | A | La Saint-Valentin |
| B | Le papier |
| 17 | A | La passion du jeu |
| B | Le bus farceur |
| 18 | A | Le mal du pays |
| B | Petit, mais costaud |
| 19 | A | Poisson d'avril |
| B | La spatule de Neptune |
| 20 | A | La pause |
| B | Le retour de "l'Homme-Sirène" |
| 21 | A | Problèmes de lacets |
| B | Les joies du dimanche |
| 22 | A | Mauvaise haleine |
| B | Pearl et ses idées |
| 23 | A | La course au titre |
| B | Marcel Bubulle |
| 24 | A | Une tarte mortelle |
| B | La valse des homards |
| 25 | A | Le papillon |
| B | Les pâtés multicolores |
| 26 | A | L'éponge à sa mamie |
| B | L'exil |
| 27 | A | Le sport avant le sommeil |
| B | Voleurs malgré eux |
| 28 | A | Patchy et le pirate |
| B | Le premier Noël |
| 29 | A | La morte saison |
| B | L'éponge abandonnée |
| 30 | A | Le permis par KO |
| B | Le plus grand fan |
| 31 | A | Les vacances de l'Homme-Sirène |
| B | Dur, dur d'être un comique |
| 32 | A | Bob manque d'air |
| B | Le canon à perles |
| 33 | A | Le Hollandais volant |
| B | Gary prend un bain |
| 34 | A | Plankton a gagné |
| B | Le crayon géant |
| 35 | A | La boîte aux secrets |
| B | L'orchestre |
| 36 | A | Service de nuit |
| B | Le capitaine amoureux |
| 37 | A | La rédaction |
| B | Les parents de Patrick |
| 38 | A | La liste des treize mots |
| B | L'artiste méconnu |
| 39 | A | La confiture de méduses |
| B | Friture olympique |
| 40 | A | La grève |
| B | Le lombric géant |
Saison 2 (2000) - 20 épisodes (41 à 60)
| N° | |
| 41 | A | Plankton patron |
| B | Le sauveteur qui a peur de l'eau |
| 42 | A | Le coqui-magique |
| B | L'hippocampe |
| 43 | A | Juste une bouchée |
| B | Le Bob, la brute et la maîtresse |
| 44 | A | Tueurs malgré eux |
| B | La boîte à tout faire |
| 45 | A | La ceinture magique |
| B | Madame Puff en prison |
| 46 | A | L'effet boule de neige |
| B | Le capitaine Krabs fait des affaires |
| 47 | A | Vu à la télé |
| B | La pièce porte-bonheur |
| 48 | A | Le club des mauviettes |
| B | Guillaume Calmarchic |
| 49 | A | Bob voit des robots partout |
| B | Les parents adoptifs |
| 50 | A | Les peintres du dimanche |
| B | Tout ce qu'un employé doit savoir |
| 51 | A | La fête de Patchy |
| B | Bob, le roi de la fête |
| 52 | A | Les tablettes de chocolat |
| B | Bernard l'ermite |
| 53 | A | Le nouvel élève |
| B | Courage, rien n'est jamais perdu |
| 54 | - | Bob l'éponge DC |
| 55 | A | Incorrigible capitaine Krabs |
| B | Faut assurer ses arrières |
| 56 | A | Un escargot pur-sang |
| B | Une nuit mouvementée |
| 57 | A | La magie de l'été |
| B | L'ours des mers |
| 58 | A | Mon nom est personne |
| B | Plankton et son armée |
| 59 | A | L'épisode perdu |
| B | Souvenons-nous de Bob l'éponge volante |
| 60 | A | Un malin, malin et demi |
| B | Les invisibles fantômes |
| 61-... | Suite prochainement |
